אם הבקשה סווגה למסלול 'ירוק' – יופק לפונה על ידי לשכת המדען הראשי, ללא בדיקה, מסמך היתר, שאותו יש להציג למנהל/ת המוסד החינוכי בו מבוקש להתבצע המחקר.
אם הבקשה סווגה למסלול 'אדום'- הבקשה תיבדק באופן מעמיק על ידי לשכת המדען הראשי. אם תאושר- יופק לפונה מסמך היתר לביצוע המחקר, שאותו יש להציג למנהל/ת המוסד החינוכי בו מבוקש להתבצע המחקר.

​באתר האינטרנט של לשכת המדען הראשי מפורטת רשימה של מאפיינים המתאימים (כל אחד בפני עצמו) לסיווג בקשה למסלול טיפול 'אדום' (למשל, בקשה הכוללת תשאול בנושא 'טראומה'). אם הבקשה אינה מתאימה לאף אחד מהמאפיינים המפורטים- היא תסווג למסלול טיפול 'ירוק'.

​באופן עקרוני , הסיווג אכן מתבצע באופן אוטומטי על ידי המערכת המקוונת בהתאמה לנתונים אותם הזין/ה מגיש/ת הבקשה. עם זאת, הסיווג ייקבע סופית על ידי בוחן/ת הבקשה מטעמה של לשכת המדען הראשי לאחר בחינת הנתונים שהוזנו.

​הטיפול בבקשות שסווגו למסלול 'הירוק' אורך ימים ספורים (ממועד הגשת הבקשה ועד הפקת מסמך ההיתר).

משך הטיפול בבקשות שסווגו למסלול 'האדום' מותנה במידת המורכבות של הבקשה (למשל, האם נדרשות התייעצויות עם יחידות אחרות במשרד המייעצות ללשכת המדען הראשי ) כמו גם במשך התגובה של הפונה לבקשות, להבהרות, לתוספות ולתיקונים, ככל שיידרשו ממנו על ידי בודק/ת הבקשה. זמן הטיפול הממוצע הינו כחודש וחצי (ממועד הגשת הבקשה ועד הפקת מסמך ההיתר)

​העברת בקשה ממסלול 'אדום' למסלול 'ירוק' ניתנת לביצוע אם התברר כי הפונה טעה באופן המענה על שאלות הסינון או שלא הבין את משמעותה של שאלה/שאלות מסוימת/מסוימות  ובעטיה של טעות זו סווגה הבקשה למסלול 'אדום' במקום למסלול 'ירוק'.

העברת בקשה ממסלול 'ירוק' למסלול 'אדום' אפשרית אם מעדיף הפונה כי הבקשה תיבדק לעומקה על ידי לשכת המדען הראשי

​במסלול 'ירוק' יש להציג למנהל/ת בנוסף למסמך ההיתר שהופק על ידי לשכת המדען הראשי את המסמכים האלה: תקציר הצעת המחקר, כלי המחקר ומכתב פניה שנועד להפצה בקרב הורי התלמידים המועמדים להיכלל במחקר (ככל שהמחקר כולל תלמידים)

במסלול 'אדום' יש להציג למנהל/ת, בנוסף למסמך ההיתר שהופק על ידי לשכת המדען הראשי, את מכתב הפניה, שנועד להפצה בקרב הורי התלמידים המועמדים להיבדק (ככל שהמחקר כולל תלמידים), וכן לפי הצורך, מסמך/ים נוסף/ים, אם מוזכר/ים מסמך/ים כזה/כאלה בהיתר שהופק.

כן, הפצת מכתב פניה להורים מטעמו של עורך/ת המחקר מחויבת. ההפצה של המכתב תתבצע על ידי הנהלת המוסד החינוכי בו/באמצעותו מתוכנן להתקיים המחקר. את נוסח המכתב המבוקש להפצה יש לצרף כחלק ממסמכי הבקשה להיתר (לביצוע המחקר)

בהתאם לאפיוני המחקר, הפנייה להורים תכלול אחת (ורק אחת) מאפשרויות אלה: יידוע ההורים בנוגע למחקר המתוכנן להתבצע בהשתתפות ילדם, בדיקת אי התנגדותם של ההורים להשתתפות ילדם במחקר, בקשת הסכמתם של ההורים להשתתפות ילדם במחקר.​

​במקרה בו מבוקשות להתבצע 3-1 תצפיות בשיעורים המתנהלים במוסד החינוכי , תוך תיעודן בכתב בלבד וללא רישום של פרט כלשהו המזהה את התלמידים הנצפים.

​במקרה בו מתקיים לפחות אחד מהמצבים הבאים נדרשת הסכמה בכתב של ההורים כתנאי להכללת ילדם במחקר:

• המחקר יכלול איסוף מידע מזוהה;
• המחקר יכלול פעולה אחת לפחות בהשתתפות ילדים בגני ילדים;
• מתוכננת להתבצע פעולה מחקרית במסגרת פרטנית;
• מתוכננת להתבצע פעילות מחקרית הכוללת תלמידים ספציפיים מתוך קבוצה, כגון כיתה  (תתבצע פנייה להורי התלמידים הספציפיים  המועמדים להיכלל במחקר).  
•  המחקר יכלול שימוש במכשיר או באביזר, שאינו חלק מהציוד השגרתי המשמש את התלמיד במוסד החינוכי;
•  במסגרת המחקר יתבקשו התלמידים הנבדקים לדרג את עמיתיהם לכיתה על פי יחסי ריחוק- קרבה ביניהם (הערכה סוציומטרית);
• המחקר יכלול לפחות פעולה אחת המחויבת באישור ועדת הלסינקי של משרד הבריאות כתנאי סף לביצועה;
• המחקר יעסוק בלפחות אחד מנושאים אלה: התנהגויות סיכון, התנהגויות אלימות, בריונות או הצקות, מצוקה נפשית,  מיניות, טראומה  הפרעה נפשית, אמונה דתית כחלק עיקרי במחקר. 

​בכל מקרה בו מתוכננת להתבצע פעולת איסוף מידע מתלמידים או על אודותיהם שאיננה נמנית עם אף לא אחת מהפעולות המתוארות בשני הסעיפים הקודמים שלעיל, נדרשת פנייה בכתב להורים לבדיקת אי התנגדותם להכללת ילדם במחקר. הפנייה תתבצע לפחות שבוע לפני תחילת איסוף המידע המתוכנן במוסד החינוכי.

כן, אך מימוש ההיתר יותנה באי קיומן של מגבלות מטעמם של משרדי הממשלה הנוגעים בדבר, שיש בהן כדי למנוע את כניסתם של גורמים חיצוניים למוסדות החינוך (ובכלל זאת, חוקרים המבקשים לבצע בהם מחקרים) לאור החשש להתפשטות הנגיף.

לאור זאת, מומלץ לגבש חלופה להליך איסוף המידע המתוכנן במסגרת המחקר, שתאפשר את ביצועו ללא כניסה פיזית למוסד החינוכי.

​

כן, בכפוף לאלה:

1. אילו התבצע המחקר במוסד החינוכי, הייתה הבקשה המתייחסת אליו מסווגת ל"מסלול טיפול ירוק"
2. הבקשה אינה כוללת התקשרות מקוונת מרחוק (למשל, באמצעות תוכנת zoom ) בין עורך/י המחקר לבין הנבדקים
3. אם הבקשה כוללת שימוש בכלי מחקר מקוונים, המידע ייאסף באופן שאינו מזהה את הנבדקים. 

דוגמה לפעולה אותה ניתן להתיר במסגרת "המסלול הירוק": הפצת שאלון לא מזוהה ולא רגיש למילוי עצמי על ידי הנבדקים,  בדואר/במייל או בדרך אחרת. יש לשים לב, כי בהעדר אפשרות למסור לעורך/י המחקר את פרטי ההתקשרות עם הנבדקים/הוריהם, שהיו נחוצים לו/להם לצורך הפצת השאלון בכוחות עצמו/ם, ההפצה תתבצע על ידי נציג המוסד החינוכי. לצורך זאת, על עורך/י המחקר לספק להנהלת המוסד את נוסח הפנייה מטעמו/ם למועמדים להיבדק/להורים יחד עם הכמות הנחוצה של עותקי השאלון או הקישור האינטרנטי, שבאמצעות הכניסה אליו ימולא השאלון.  

​

1. במקרה של איסוף מידע מזוהה, מהי היכולת של עורך/י המחקר להגן על המידע שייאסף באופן שיבטיח את שמירת פרטיותם של כלל המשתתפים במחקר, בהלימה להנחיות בנושא של היחידה לאבטחת מידע במשרד החינוך?
2. כיצד תתבצע ההגנה על פרטיותם של המשתתפים במחקר באופן מיטבי, לנוכח התקשרות מקוונת עמם, במסגרתה הם עשויים להיחשף בפני עורך/י המחקר בחדרם הפרטי או במקום אחר בביתם/במקום ההתקשרות (גם במקרה שבו לא יתועדו פרטים המזהים אותם במהלך התקשרות זו)?    
3. במקרה של תשאול בנושאים רגשיים, ובפרט בקרב תלמידים:  כיצד תסופק מעטפת תמיכה הולמת במשתתפים בשלושה שלבים: לקראת ההשתתפות באיסוף המידע, במהלכה ולאחר סיומה?
4. במקרה של ראיונות/הנחיית קבוצת מיקוד: מהם הדגשים שיינתנו לצורך הכשרת אוסף/י המידע לעריכת הפעולה באמצעות התקשרות מרחוק?
5. במקרה של תצפיות מקוונות בשיעורים: כיצד תובטח זכותו של כל משתתף בשיעור והוריו לא להיות מושא לתצפית המבוקשת מבלי שתיפגע השתתפותו בשיעור בדרך כלשהי?

​כן, במרבית המקרים ההיתר יותנה בכך שהנתונים לא יימסרו במתכונתם הגולמית אלא במתכונתם המעובדת בלבד, כך שלא יכללו כל פרט המזהה תלמיד, בעל תפקיד או כל אדם אחר (ככל שתועדו פרטים מזהים בחומרי הגלם המקוריים המבוקשים למסירה).